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二本和三本合并，不是学校合并，是录取批次合并，取消三本批次，并入二本批次，合并招生。三本多为民办和独立学院，毕业证不变。三本院校的学费普遍比较贵。
二本和三本区别
1、二本，即本科二批，是指放在中国高考录取招生的时候在本科层次第二批次招生的学校，录取线一般要达到本科线。学年制通常为4—5年，学生毕业后颁发本科学历毕业证和学士学位证书。
本科二批院校通常包括部分地方所属高等院校（包括部分地方所属的重点大学和一般高校）和少数实力较好的民办院校。部分省市的高考志愿已经将本科二批和本科三批合并共同招生。
2、三本，即第三批本科，是指中国大陆高等教育本科层次录取批次和录取顺序排在第三批次。三本院校的招生是根据参加全国统一高考录取的方式进行的。 三本属于“普通高等学校”教育系列，学制为四年，毕业证书和学位证书都是“普通高等学校”教育证书，“第三批本科”录取院校为独立学院和民办高校。
二三本合并的优点和缺点
以前二本三本是划分了分数线在规定时间段录取，现在是全部统一在一起录取，没有明显的分数线，但是依然存在三本这个说法，体现在学费和招录分数。对于二本生来说，跟三本生没有严格区分，如果学校报不好就直接变为所谓的三本生。
三本生则可以考上二本，但是，在招录的时候如果没掌握好详细资讯盲目报了二本院校，那就要继续复读。好处是，确保三本生和二本生的社会地位平等，没有等级划分。