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2020年南京中医药大学按学年收取费用，文科类专业的学费为5200元/生/学年，理科类专业的学费为5500元/生/学年，工科类专业的学费为5800元/生/学年，医学类专业的学费为6800元/生/学年，中外合作专业的学费为22000元/生/学年。
南京中医药大学重点学科
国家重点学科：中药学、中医医史文献、中医儿科学
国家重点（培育）学科：中医学、中医内科学
江苏省高校优势学科建设工程：中医学、中药学、中西医结合、护理学
国家中医药管理局“十一五”重点学科：方剂学、温病学、中医儿科学、中医妇科学、中医肝胆病学、针灸学、药用植物学、中药药理学、中药炮制学、中医医史文献学、中医护理学、中医脾胃病学、中医肾病学、中医肛肠病学
国家中医药管理局“十二五”重点学科：伤寒学、中医诊断学、临床中药学、中西医结合基础 、中医痹病学、中医肿瘤学、中医骨伤科学、中医耳鼻喉科学、中医养生学、推拿学、中药药剂学、中药化学、中药资源化学、中医药信息学、中医文化学、中医药管理学、中医皮肤病学、中西医结合临床、中医心病学
江苏省重点学科：中医临床基础、方剂学、中医诊断学、中医内科学、中医外科、中医妇科、针灸推拿学
学费数据来源：南京中医药大学2020年全日制普通本科招生章程（https://gaokao.chsi.com.cn/zsgs/zhangcheng/listVerifedZszc--infoId-2731388188,method-view,schId-244.dhtml）